ไฟล์นามสกุล .cram
ประเภทไฟล์Compressed Alignment File
ผู้พัฒนา | EBI |
หมวดหมู่ | Data Files |
รูป | Binary |
.CRAM หมายเลขตัวเลือก
รูปแบบไฟล์การจัดตำแหน่งแบบบีบอัดที่พัฒนาโดย EBI ซึ่งเป็น outstation ของห้องปฏิบัติการชีววิทยาโมเลกุลยุโรป เก็บการจัดตำแหน่งการอ่านลำดับดีเอ็นเอสั้น ๆ ที่สร้างจากตัวอ่านระยะสั้นเช่น BWA, BBMap และ BLAT
รูปแบบไฟล์ CRAM คล้ายกับรูปแบบไฟล์ Binary Alignment / Map (BAM) แต่มีการบีบอัดไฟล์ที่ดีกว่าและรูปแบบไบนารีของคอลัมน์ที่ปรับโครงสร้างแล้ว เมื่อปริมาณข้อมูลเพิ่มขึ้นในเขตข้อมูลซอฟต์แวร์ทางพันธุกรรมรูปแบบ CRAM ได้รับการออกแบบเพื่อลดการพิมพ์แผ่นดิสก์ของข้อมูลการจัดตำแหน่ง
การจัดตำแหน่งการอ่านแบบสั้นเป็นกระบวนการถอดรหัสที่ลำดับมาจากจีโนม สิ่งนี้อาจเป็นเรื่องยากเนื่องจากจีโนมการอ้างอิงค่อนข้างใหญ่และคุณไม่ได้มองหาการจับคู่ที่แน่นอนในจีโนมอ้างอิงเสมอไป เครื่องมือจัดตำแหน่งแบบอ่านสั้น ๆ จะใช้ในการค้นหาลำดับขนาดใหญ่สำหรับการแข่งขันและการแข่งขันที่ใกล้เคียง เนื่องจากลำดับมีขนาดใหญ่มากการบีบอัดที่มีรูปแบบเช่น CRAM จึงจำเป็นสำหรับการรักษาขนาดไฟล์ให้สามารถจัดการได้
Windows |
|