Integrated Genome Browser
| รุ่น |
9 |
| เวทีs | |
| อนุญาต | Open Source |
| หมวดหมู่ | Scientific |
| ข้อมูลเพิ่มเติม
(เยี่ยมชมเว็บไซต์ของผู้เผยแพร่)
|
รีวิวซอฟต์แวร์
ฟังก์ชั่นหลัก
- รองรับรูปแบบจีโนมต่างๆเช่น GenBank และ FASTA
- โต้ตอบกับข้อมูลด้วยการซูมและการแพนภาพเคลื่อนไหว
- เข้าถึงและโหลดจีโนมจากไซต์ QuickLoad
- แปลงข้อมูลเป็นรูปแบบกราฟที่หลากหลาย
- แบ่งปันข้อมูลกับผู้ทำงานร่วมกันผ่าน Dropbox
- ติดตั้งปลั๊กอินสำหรับการใช้งานเพิ่มเติม
Integrated Genome Browser (IGB) เป็นโปรแกรมโอเพ่นซอร์สที่ใช้ในการดูและสำรวจชุดข้อมูลจีโนมขนาดใหญ่ คุณสามารถดูรูปแบบข้อมูลต่างๆโต้ตอบกับข้อมูลของคุณสร้างกราฟบันทึกข้อมูลของคุณเป็นรูปภาพและแบ่งปันข้อมูลกับผู้ทำงานร่วมกัน
IGB ช่วยให้คุณสามารถดูข้อมูลจากคำอธิบายประกอบและลำดับที่จัดแนวได้ โปรแกรมรองรับรูปแบบที่หลากหลายเช่น FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband และ GenBank คุณสามารถนำข้อมูลและแปลงเป็นรูปแบบกราฟที่หลากหลายรวมถึงกราฟที่ไม่ตรงกันสำหรับการเน้นความแตกต่างของข้อมูลและกราฟความลึกเพื่อแสดงการครอบคลุม นอกจากนี้คุณยังสามารถโต้ตอบกับข้อมูลของคุณผ่านภาพเคลื่อนไหวการซูมและการแพนของ IGB
IGB ช่วยให้คุณสามารถเข้าถึงและโหลดจีโนมจากไซต์ QuickLoad ซึ่งเป็นระบบที่ง่ายของไดเรกทอรีลำดับและไฟล์ข้อมูลอื่น ๆ เพื่อการสร้างภาพ IGB มีฟังก์ชันการทำงานขั้นสูงพร้อมการสนับสนุนปลั๊กอินเพื่อเพิ่มฟังก์ชันการทำงานและการทำงานอัตโนมัติในเวิร์กโฟลว์ผ่านการใช้สคริปต์ IGB ยังให้คุณสมบัติขั้นสูงสำหรับการแบ่งปันข้อมูลของคุณไม่ว่าจะเป็นการเผยแพร่เป็นภาพ JPEG คุณภาพสูง PNG หรือ SVG หรือจัดเก็บข้อมูลใน Dropbox เพื่อให้ผู้ทำงานร่วมกันสามารถเข้าถึงโครงการของคุณ
IGB คือ ส่วนใหญ่ใช้โดยนักวิจัยของมหาวิทยาลัยนักชีววิทยาและชีวสารสนเทศศาสตร์ มันมีเครื่องมือขั้นสูงสำหรับการเปิดรูปแบบข้อมูลจีโนมที่หลากหลายการแสดงข้อมูลเป็นกราฟที่แตกต่างกันและแบ่งปันข้อมูลกับผู้ทำงานร่วมกัน น่าเสียดายที่โปรแกรมนี้ใช้เงินทุนสำหรับการพัฒนาอย่างต่อเนื่องซึ่งหมายความว่าการสนับสนุนสำหรับแอปพลิเคชันสามารถหยุดได้ตลอดเวลา อย่างไรก็ตาม Integrated Genome Browser ยังเป็นโปรแกรมที่สามารถปรับแต่งได้สำหรับผู้ใช้ที่ต้องการสำรวจและวิเคราะห์ข้อมูลจีโนม
อัปเดตเมื่อ: 29 มิถุนายน 2016
▶ นามสกุลไฟล์อื่น ๆ ที่ใช้ Integrated Genome Browser 9
| ประเภทไฟล์ที่รองรับ | |
|---|---|
| .BED | UCSC BED Annotation Track File |
| .GB | GenBank Data File |
| .FASTA | FASTA Sequence File |
| .DAS | DeltaMaster Analysis Session |
| .SGR | SGR Genome Data File |
| .FA | FASTA Formatted Sequence File |
| .USEQ | USeq Genome Data File |
| รูปแบบไฟล์เพิ่มเติมที่เกี่ยวข้อง |
|---|